DATA

stdClass Object
(
    [nadpis] => 
    [apiurl] => https://studuj-api.cis.vscht.cz/cms/?weburl=/sis
    [urlwildcard] => cis-path
    [sitemapno] => 
    [newurl_domain] => 'uen.vscht.cz'
    [newurl_jazyk] => 'cs'
    [newurl_akce] => '/sis/program/22330/AD301'
    [newurl_iduzel] => 
    [newurl_path] => 1/4111/959/8547/4161/1398/8548/4168/4169/8547/4156/1394/8548/39341/39376/8548/48364/48365/8548/43892/43893/8548/39341/39375/8548/38914/38915/8548/29628/29629/8548/43413/8548/28158/28159/8548/24136/24137/8548/28861/28894/8548/25669/25670/8548/20508/20509/8548/22498/22499/8548/4162/1338/8548/15102/15103/8548/10022/10023/8548/4163/1558/8548/4164/945/8548/4165/1404/8548/4168/1410/8548/5338/5339/8548/6214/6522/8548/6996/6998/8548/7924/7930/8548/7924/7930/7941/8548/7922/7926/8548/4167/1406/8548/11349/11351/1/12984/12985/8548/42398/42399/8547/11265/11271/8547/4154/1408/8547/4160/1399/8547/4156/1393/1/4111/942/8547/4161/1397/8547/4159/1395/1/1401/13358/519/61411
    [newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
    [iduzel] => 61411
    [platne_od] => 29.10.2021 16:18:00
    [zmeneno_cas] => 29.10.2021 16:20:22.679723
    [zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
    [canonical_url] => 
    [idvazba] => 72838
    [cms_time] => 1716083087
    [skupina_www] => Array
        (
        )

    [slovnik] => Array
        (
        )

    [poduzel] => Array
        (
        )

    [sablona] => stdClass Object
        (
            [class] => api_html
            [html] => 
            [css] => 
            [js] => 
            [autonomni] => 1
        )

    [api_suffix] => program/22330/AD301
    [html] => 


    
        

        
            
                
                    
                
            
        
        
            




    Microbiology
    
        
            Doktorský program,
        Fakulta potravinářské a biochemické technologie
    
    The purpose of the study programme is to train specialists with a comprehensive understanding of microbial populations, their activity, phylogenetic and metabolic diversity, mechanisms controlling targeted changes of their genetic information or chemical principles affecting the relationship within microbial communities. The study programme is based on the combination of various forms of tuition and laboratory research, with the main emphasis on independence, initiative and critical approach of students. Alumni of this study programme should be able to routinely use any of the acquired knowledge, skills and competences for industrial or other applications.

    
        
            Uplatnění
            Alumni of this study programme should have a comprehensive microbiological, biochemical and engineering background that will enable them to fully understand the microbial world. They will dispose of deep theoretical insight as well as practical skills in all key areas of microbiology, including biochemistry of microorganisms, molecular biology, genetic engineering and other closely related fields. The alumni of the study programme will find employment in all areas of biotechnology, food, pharmaceutical or chemical industry, in clinical laboratories, in the field of environmental sciences and agriculture. Last but not least, the alumni should be highly competent to work in academia.
        
    





    
        Detaily programu
        
            
                Jazyk výuky
                
                anglický
            
            
                
                    
                        Standardní doba studia
                    
                
                
                4 roky
            
            
                Forma studia
                
                
                    
                        kombinovaná
                    , 
                        prezenční
                    
                
            
            
                
                    Garant studia
                    
                    
                        prof. Ing. Bc. Ondřej Uhlík, Ph.D.
                    
                
            
            
                Místo studia
                
                Praha
            
            
                Kapacita
                
                15 studentů
            
            
                Kód akreditace (MŠMT kód)
                
                 P0511D130022
            
            
                VŠCHT kód
                
                
                    AD301
                
            
            
                
                    Počet vypsaných témat
                    
                     4
                
            
        
    


    
        
            
                
                    
                        Studijní plán
                    
                
            
        
        
        
        
        
        
            
                
                    
                        Přihlašování nyní není otevřeno
                    
                
            
        
    



    
    Vypsané disertační práce pro rok
        2024/25
    
        




    Interakce bakterií rodu Bordetella s respiračním epitelem


    
        Garantující pracoviště:
        
            
                Ústav biochemie a mikrobiologie
            
            
                
                    

                
                Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
            
        
    
    
    
    
    
        Školitel:
        RNDr. Jana Kamanová, Ph.D.

    
    


Anotace


Klasické bordetely infikují dýchací trakt savců. B. bronchiseptica je původcem chronických respiračních infekcí u řady savců, zatímco B. pertussis a B. parapertussis HU způsobují akutní respirační onemocnění známé jako černý kašel nebo pertuse. Tyto bakterie vytvářejí biofilmy jak na abiotických površích, tak i v dýchacím traktu, což slouží jako mechanismus úniku před imunitním system, a představuje cíl nových antimikrobiálních látek. Cílem dizertační práce je odhalit signální dráhy, které stojí za kolonizací respiračního epitelu bakteriemi rodu Bordetella a tvorbou biofilmu. Doktorand použije model ALI (air-liquid interface) lidského nosního epitelu a mikroinženýrský biomimetický systém, tzvn. organ-on-a-chip, v kombinaci s metabolomikou, metodou dual RNA-Seq a genovým inženýrstvím.


    
        kontaktujte vedoucího práce
    

    Místo výkonu práce:
    Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.





    
        




    Podíl mikroorganismů na produkci skleníkových plynů v zalesněných bažinách severní Evropy


    
        Garantující pracoviště:
        
            
                Ústav biochemie a mikrobiologie
            
            
                
                    

                
                Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
            
        
    
    
    
    
    
        Školitel:
        Dr. Ing. RNDr. Petr Baldrian, Ph.D.

    
    


Anotace


Severské bažiny jsou významnými zdroji skleníkových plynů se značným vlivem na klima - methanu, oxidu dusnatého i oxidu uhličitého. K omezení emisí se často volí kombinace odvodnění bažin a jejich zalesnění. Přestože tímto způsobem lze produkci skleníkových plynů omezit, jejich emise stále pokračují a jejich množství závisí na hospodaření v lesích. Tok skleníkových plynů je nicméně také regulován dalšími faktory, například sezónní aktivitou vegetace a mikroorganismů. Protože mikroorganismy jsou zodpovědné za produkci skleníkových plynů v půdách bažinných lesů, leží klíč k odhalení příčin jejich produkce v porozumění jejich aktivitám a faktorům, které je regulují. V této práci využijeme terénní experimenty na studijních plochách v jižním Finsku, kde probíhá monitoring produkce skleníkových plynů a informace o složení a funkci mikrobiomu v různých vrstvách rašeliny lze vztáhnout k pozorované produkci plynů z půdy. Práce nabídne jak terénní, tak laboratorní práci a analýzu bioinformatických dat. Úspěšné vyřešení práce by mělo napomoci zvolit vhodný management bažinných lesů tak, aby byla produkce skleníkových plynů omezena a aby se zvýšilo ukládání uhlíku z atmosféry do lesní půdy.


    
        kontaktujte vedoucího práce
    

    Místo výkonu práce:
    Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.





    
        




    Studium vstupu respiračních virů do buňky: Porovnání interaktomů koronavirů a viru chřipky A během časné fáze infekce


    
        Garantující pracoviště:
        
            
                Ústav biochemie a mikrobiologie
            
            
                
                    

                
                Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.
            
        
    
    
    
    
    
        Školitel:
        Mgr. Jan Weber, CSc.

    
    


Anotace


Vstup virů do hostitelské buňky je důležitý první krok, hlavně u respiračních virů s velkým pandemickým potenciálem jako je SARS-CoV-2 a virus chřipky A. Porovnání interaktomů koronavirů a viru chřipky A a porozumění časným interakcím virových a buněčných proteinů může pomoci při vývoji cílené, nebo naopak širokospektrální antivirové terapie. Hlavním cílem tohoto projektu je porozumět virovým a buněčným faktorům ovlivňujícím vstup respiračních virů do buňky. Za tímto účelem použijeme několik kmenů koronavirů a viru chřipky A, u kterých je známo, že využívají různé cesty vstupu do hostitelské buňky, a porovnáme jejich buněčný interaktom v době vstupu a během časných fází infekce. Z identifikovaných buněčných interakčních partnerů budou vybráni zajímaví kandidáti, kteří budou dále zkoumáni z hlediska jejich role v životním cyklu viru. Student se naučí pracovat s tkáňovými kulturami v laboratoři s úrovní technického zabezpečení 3, analyzovat proteomická a bioinformační data, a provádět siRNA experimenty snižující genovou expresi v savčích buňkách infikovaných různými viry. Navržený projekt rozšíří naše současné vědění o časné fázi infekce savčích buněk respiračními viry.


    
        kontaktujte vedoucího práce
    

    Místo výkonu práce:
    Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.





    
        




    Vliv managementu lesa na půdní mikrobiální společenstva a environmentální procesy v půdě


    
        Garantující pracoviště:
        
            
                Ústav biochemie a mikrobiologie
            
            
                
                    

                
                Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
            
        
    
    
    
    
    
        Školitel:
        Dr. Ing. RNDr. Petr Baldrian, Ph.D.

    
    


Anotace


Těžba dřeva v lesích je ekonomicky významná, ale zároveň představuje často dramatický zásah do fungování lesních ekosystémů, které plní významné ekologické role. Zatímco obvyklým přístupem těžby v lesích mírného a severského pásma je holoseč (těžba všech dospělých stromů), stále více se využívá i retenčního hospodaření, při němž je část stromů po těžbě ponechávána nesklizená. Záměrem retenčního hospodaření je zachování struktury a funkce tak, aby regenerace lesního porostu po těžbě byla co nejrychlejší a nejúspěšnější. Těžba stromů zásadně ovlivňuje ekosystémové procesy v lese - snižuje se vstup uhlíku do půdy prostřednictvím primární produkce a mění se dostupnost živin v půdách i mikroklimatické podmínky. Těžené plochy tak poskytují příležitost pozorovat vliv snížení primární produkce na půdní procesy. Těžba má zásadní vliv zejména na hlavní skupinu symbiotických hub - ektomykorrhizní houby, které žijí v symbióze s kořeny stromů, méně je známo o vlivu těžby na další skupiny hub a bakterií. Cílem této práce je popsat krátkodobé vlivy těžby dřeva na aktivitu a složení mikrobiálních společenstev v půdách lesů, kde dominují ektomykorrhizní či arbuskulárně mykorrhizní houby. Změny ve fungování ekosystému, jako je rozklad organické hmoty nebo procesy cyklu dusíku budou popsány pomocí analýzy genomového potenciálu a transkripce půdních mikroorganismů. Práce by tak měla objasnit, jak se mění mikrobiální procesy v půdě po disturbanci porostu a poskytnout podklady pro volbu takového hospodaření v lesích, které bude co nejšetrnější a přispěje k zachování funkcí lesa a ukládání uhlíku do lesních půd.


    
        kontaktujte vedoucího práce
    

    Místo výkonu práce:
    Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.





    


        
    


)

Vedoucí ústavu:	doc. Ing. Michael Pohořelý, Ph.D.	e 22044 3051
Tajemnice:	Ing. Hana Juklíčková	e 22044 3125
Adresa:	Ústav energetiky VŠCHT Praha Technická 3 166 28 Praha 6
Tel.:	+420 22044 3125
E-mail:	hana.juklickova@vscht.cz

Vedoucí ústavu:	doc. Ing. Jan Macák, CSc.	e 22044 3051 / 22044 3133
Tajemnice:	Ing. Hana Juklíčková	e 22044 3125
Adresa:	Ústav energetiky VŠCHT Praha, Technická 3, 166 28 Praha 6
Tel.:	+420 22044 3125
Fax:	+420 22044 3898
E-mail:	hana.juklickova@vscht.cz

Vedoucí ústavu:

e 22044 3051

Tajemnice:

Ing. Hana Juklíčková

e 22044 3125

Adresa:

Ústav energetiky VŠCHT Praha

Technická 3

166 28 Praha 6

Tel.:

+420 22044 3125

E-mail:

hana.juklickova@vscht.cz

Bakalářské studium

Magisterské studium

Doktorské studium (1. - 4. ročník)

Doktorské studium (5. - 7. ročník)

Vedoucí ústavu:

doc. Ing. Jan Macák, CSc.

e 22044 3051 / 22044 3133

Tajemnice:

Ing. Hana Juklíčková

e 22044 3125

Adresa:

Ústav energetiky VŠCHT Praha, Technická 3, 166 28 Praha 6

Tel.:

+420 22044 3125

Fax:

+420 22044 3898

E-mail:

hana.juklickova@vscht.cz

Chyba 404

DATA

Microbiology

Uplatnění

Detaily programu

Vypsané disertační práce pro rok 2024/25

Interakce bakterií rodu Bordetella s respiračním epitelem

Anotace

Podíl mikroorganismů na produkci skleníkových plynů v zalesněných bažinách severní Evropy

Anotace

Studium vstupu respiračních virů do buňky: Porovnání interaktomů koronavirů a viru chřipky A během časné fáze infekce

Anotace

Vliv managementu lesa na půdní mikrobiální společenstva a environmentální procesy v půdě

Anotace